Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VCPIP1Q96JH7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms