Protein–RNA interactions for Protein: Q96J86

CYYR1, Cysteine and tyrosine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYYR1Q96J86 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYYR1Q96J86 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYYR1Q96J86 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms