Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUNDC1Q96C34 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNDC1Q96C34 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms