Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYAP1Q96A49 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYAP1Q96A49 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms