Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF34Q969K3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms