Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO1Q92973 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms