Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT35Q92764 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT35Q92764 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT35Q92764 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms