Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3AQ92664 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms