Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113Q902F9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms