Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms