Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms