Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELBQ8NG08 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms