Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIEQ8NEW7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIEQ8NEW7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms