Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A3Q8NEV1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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