Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf62Q8N4C0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms