Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACE1Q8IYU2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACE1Q8IYU2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms