Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KSR1Q8IVT5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms