Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3FQ8IUX4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms