Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNX29P2Q8IUI4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX29P2Q8IUI4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms