Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC46A3Q7Z3Q1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC46A3Q7Z3Q1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC46A3Q7Z3Q1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC46A3Q7Z3Q1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC46A3Q7Z3Q1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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