Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDXQ7Z353 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms