Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDPD3Q7L5L3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms