Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms