Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q71RC1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q71RC1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q71RC1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q71RC1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q71RC1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q71RC1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q71RC1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q71RC1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q71RC1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q71RC1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q71RC1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q71RC1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q71RC1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms