Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms