Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SFTA2Q6UW10 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms