Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP4R4Q6NUP7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPP4R4Q6NUP7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms