Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LCN8Q6JVE9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN8Q6JVE9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN8Q6JVE9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN8Q6JVE9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN8Q6JVE9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN8Q6JVE9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN8Q6JVE9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN8Q6JVE9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN8Q6JVE9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN8Q6JVE9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN8Q6JVE9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN8Q6JVE9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN8Q6JVE9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN8Q6JVE9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms