Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LCN10Q6JVE6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LCN10Q6JVE6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LCN10Q6JVE6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LCN10Q6JVE6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms