Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL3Q6DD88 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms