Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF123Q5XPI4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms