Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CARMIL1Q5VZK9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms