Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms