Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR78Q5VTH9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.1 ms