Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RSPH4AQ5TD94 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms