Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PERM1Q5SV97 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms