Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR4Q5GH76 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XKR4Q5GH76 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms