Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms