Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAN2Q504Q3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAN2Q504Q3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms