Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC1Q4ZHG4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC1Q4ZHG4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms