Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUSP28Q4G0W2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms