Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC14Q49A88 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms