Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TBRG1Q3YBR2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms