Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD55Q3KP44 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD55Q3KP44 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms