Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDRF1Q3B7T1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms