Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC96Q2M329 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms