Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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SNAPC1Q16533 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPC1Q16533 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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