Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA6Q16445 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms