Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMD5Q16401 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms