Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VAMP3Q15836 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VAMP3Q15836 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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